Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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CHCHD4Q8N4Q1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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CHCHD4Q8N4Q1 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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CHCHD4Q8N4Q1 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
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