Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VPS72Q15906 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VPS72Q15906 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VPS72Q15906 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPS72Q15906 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VPS72Q15906 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VPS72Q15906 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPS72Q15906 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPS72Q15906 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPS72Q15906 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207 ms