Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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COL9A2Q14055 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
COL9A2Q14055 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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COL9A2Q14055 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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COL9A2Q14055 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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COL9A2Q14055 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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COL9A2Q14055 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A2Q14055 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A2Q14055 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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