Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HOXA4Q00056 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXA4Q00056 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXA4Q00056 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXA4Q00056 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 416.6 ms