Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHCHD3Q9NX63 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHCHD3Q9NX63 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHCHD3Q9NX63 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CHCHD3Q9NX63 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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