Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VSTM4Q8IW00 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VSTM4Q8IW00 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
VSTM4Q8IW00 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VSTM4Q8IW00 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.9 ms