Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALYREFQ86V81 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALYREFQ86V81 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ALYREFQ86V81 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ALYREFQ86V81 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ALYREFQ86V81 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALYREFQ86V81 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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