Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD1Q6SPF0 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD1Q6SPF0 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD1Q6SPF0 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD1Q6SPF0 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD1Q6SPF0 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SAMD1Q6SPF0 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SAMD1Q6SPF0 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SAMD1Q6SPF0 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SAMD1Q6SPF0 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SAMD1Q6SPF0 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SAMD1Q6SPF0 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SAMD1Q6SPF0 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SAMD1Q6SPF0 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SAMD1Q6SPF0 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SAMD1Q6SPF0 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SAMD1Q6SPF0 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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