Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMC1AQ14683 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMC1AQ14683 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
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