Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL9A2Q14055 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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COL9A2Q14055 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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COL9A2Q14055 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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COL9A2Q14055 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
COL9A2Q14055 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
COL9A2Q14055 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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