Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RIGQ13278 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RIGQ13278 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIGQ13278 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIGQ13278 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIGQ13278 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIGQ13278 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIGQ13278 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIGQ13278 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIGQ13278 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIGQ13278 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIGQ13278 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIGQ13278 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIGQ13278 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIGQ13278 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIGQ13278 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIGQ13278 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIGQ13278 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIGQ13278 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIGQ13278 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIGQ13278 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIGQ13278 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIGQ13278 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIGQ13278 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIGQ13278 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIGQ13278 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIGQ13278 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIGQ13278 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIGQ13278 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIGQ13278 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIGQ13278 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIGQ13278 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIGQ13278 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIGQ13278 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIGQ13278 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIGQ13278 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIGQ13278 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIGQ13278 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIGQ13278 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIGQ13278 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIGQ13278 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIGQ13278 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIGQ13278 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIGQ13278 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIGQ13278 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIGQ13278 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIGQ13278 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIGQ13278 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIGQ13278 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIGQ13278 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIGQ13278 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIGQ13278 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIGQ13278 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIGQ13278 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIGQ13278 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RIGQ13278 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIGQ13278 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIGQ13278 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIGQ13278 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RIGQ13278 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIGQ13278 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RIGQ13278 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RIGQ13278 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RIGQ13278 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RIGQ13278 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIGQ13278 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIGQ13278 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIGQ13278 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIGQ13278 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RIGQ13278 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RIGQ13278 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RIGQ13278 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RIGQ13278 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RIGQ13278 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RIGQ13278 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.9 ms