Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NME3Q13232 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NME3Q13232 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NME3Q13232 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NME3Q13232 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NME3Q13232 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NME3Q13232 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NME3Q13232 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NME3Q13232 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NME3Q13232 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NME3Q13232 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NME3Q13232 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NME3Q13232 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NME3Q13232 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NME3Q13232 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NME3Q13232 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NME3Q13232 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NME3Q13232 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NME3Q13232 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NME3Q13232 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NME3Q13232 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NME3Q13232 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NME3Q13232 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NME3Q13232 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NME3Q13232 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NME3Q13232 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NME3Q13232 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NME3Q13232 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NME3Q13232 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NME3Q13232 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NME3Q13232 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NME3Q13232 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NME3Q13232 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NME3Q13232 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NME3Q13232 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NME3Q13232 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NME3Q13232 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NME3Q13232 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NME3Q13232 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NME3Q13232 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NME3Q13232 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NME3Q13232 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
NME3Q13232 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NME3Q13232 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NME3Q13232 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NME3Q13232 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
NME3Q13232 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
NME3Q13232 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NME3Q13232 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NME3Q13232 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NME3Q13232 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NME3Q13232 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NME3Q13232 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NME3Q13232 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NME3Q13232 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NME3Q13232 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NME3Q13232 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NME3Q13232 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NME3Q13232 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NME3Q13232 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NME3Q13232 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NME3Q13232 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NME3Q13232 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NME3Q13232 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NME3Q13232 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NME3Q13232 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NME3Q13232 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NME3Q13232 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NME3Q13232 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NME3Q13232 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NME3Q13232 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NME3Q13232 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NME3Q13232 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
NME3Q13232 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
NME3Q13232 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
NME3Q13232 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NME3Q13232 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NME3Q13232 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NME3Q13232 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NME3Q13232 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms