Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
RPA4Q13156 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.46□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
RPA4Q13156 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
RPA4Q13156 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
RPA4Q13156 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
RPA4Q13156 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
RPA4Q13156 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
RPA4Q13156 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
RPA4Q13156 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
RPA4Q13156 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
RPA4Q13156 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
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