Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRIM32Q13049 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM32Q13049 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRIM32Q13049 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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TRIM32Q13049 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRIM32Q13049 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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TRIM32Q13049 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRIM32Q13049 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM32Q13049 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM32Q13049 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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