Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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FOXF1Q12946 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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FOXF1Q12946 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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FOXF1Q12946 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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FOXF1Q12946 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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FOXF1Q12946 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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FOXF1Q12946 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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FOXF1Q12946 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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FOXF1Q12946 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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