Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
VPREB1P12018 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
VPREB1P12018 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VPREB1P12018 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.5 ms