Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
LINC00052Q96N35 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00052Q96N35 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
LINC00052Q96N35 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
LINC00052Q96N35 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms