Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.6 ms