Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
C9orf135Q5VTT2 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
C9orf135Q5VTT2 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
C9orf135Q5VTT2 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
C9orf135Q5VTT2 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
C9orf135Q5VTT2 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
C9orf135Q5VTT2 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
C9orf135Q5VTT2 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
C9orf135Q5VTT2 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
C9orf135Q5VTT2 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
C9orf135Q5VTT2 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.7 ms