Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RNF20Q5VTR2 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RNF20Q5VTR2 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RNF20Q5VTR2 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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RNF20Q5VTR2 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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RNF20Q5VTR2 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNF20Q5VTR2 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNF20Q5VTR2 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNF20Q5VTR2 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RNF20Q5VTR2 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RNF20Q5VTR2 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RNF20Q5VTR2 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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