Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ODF1Q14990 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ODF1Q14990 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ODF1Q14990 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ODF1Q14990 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.1 ms