Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A2Q14055 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A2Q14055 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A2Q14055 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A2Q14055 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A2Q14055 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
COL9A2Q14055 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COL9A2Q14055 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL9A2Q14055 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
COL9A2Q14055 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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