Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
DDX39BQ13838 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
DDX39BQ13838 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
DDX39BQ13838 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
DDX39BQ13838 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
DDX39BQ13838 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
DDX39BQ13838 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.8 ms