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Protein–RNA interactions for Protein: Q13618
CUL3, Cullin-3, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL3
Q13618
Y_RNA.244-201
ENST00000364484
109 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
CUL3
Q13618
MIR587-201
ENST00000384845
96 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
CUL3
Q13618
SNORD57-201
ENST00000448188
72 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
CUL3
Q13618
Y_RNA.698-201
ENST00000516798
118 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
CUL3
Q13618
MIR3115-201
ENST00000577915
68 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
CUL3
Q13618
MIR3675-201
ENST00000583661
73 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
CUL3
Q13618
MIRLET7A1-201
ENST00000362295
80 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNU6-645P-201
ENST00000364649
106 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
SNORD114-17-201
ENST00000364699
75 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
snoMBII-202.2-201
ENST00000517263
86 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNU6-924P-201
ENST00000362926
108 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNA5SP192-201
ENST00000364404
120 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNU6-49P-201
ENST00000384256
107 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNU6-1157P-201
ENST00000384456
106 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
Y_RNA.593-201
ENST00000410292
98 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
AC074348.1-201
ENST00000426503
132 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
SCARNA18B-201
ENST00000458806
135 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
U2.7-201
ENST00000619197
100 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
Y_RNA.532-201
ENST00000384590
113 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
MIR548C-201
ENST00000384815
97 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNU6-604P-201
ENST00000390917
100 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNY1P9-201
ENST00000532431
109 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
MIR3165-201
ENST00000579874
75 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
IGLL4P-201
ENST00000614590
133 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
Y_RNA.73-201
ENST00000362910
113 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
Y_RNA.219-201
ENST00000364232
113 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNY1P1-201
ENST00000364372
112 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
Y_RNA.607-201
ENST00000410597
98 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
RNU6-807P-201
ENST00000516805
107 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
MIR4484-201
ENST00000582855
83 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CUL3
Q13618
Y_RNA.514-201
ENST00000384528
112 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
Y_RNA.583-201
ENST00000391033
113 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNU6-380P-201
ENST00000410207
107 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
MIR4306-201
ENST00000583390
91 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNU6-431P-201
ENST00000383874
107 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
Y_RNA.426-201
ENST00000384068
113 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
MIR147A-201
ENST00000385079
72 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
MIR1297-201
ENST00000637311
77 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
SNORD45.1-201
ENST00000363181
77 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
SNORD64-201
ENST00000386683
67 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNY4P30-201
ENST00000410216
95 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNA5SP461-201
ENST00000516451
104 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNU6-153P-201
ENST00000364422
104 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
MIR5588-201
ENST00000581890
63 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
Y_RNA.613-201
ENST00000410726
97 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNU6-982P-201
ENST00000516216
102 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNU6-315P-201
ENST00000362666
107 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNU6-1233P-201
ENST00000362922
102 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
MIR548AG1-201
ENST00000579932
66 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
MIR382-201
ENST00000637119
76 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CUL3
Q13618
RNU6-979P-201
ENST00000383896
107 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
SNORA26.4-201
ENST00000391188
123 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
MIR4320-201
ENST00000636981
65 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
Y_RNA.316-201
ENST00000365118
111 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
TRAJ53-201
ENST00000390485
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU6-1089P-201
ENST00000516473
104 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU6-706P-201
ENST00000517229
104 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
FAS-AS1.1-201
ENST00000615327
126 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
MIR409-201
ENST00000362237
79 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
SNORD115-33-201
ENST00000363723
82 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU7-174P-201
ENST00000516248
59 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
snoU83B.1-201
ENST00000517136
88 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU6-1216P-201
ENST00000362590
107 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
SNORD63.1-201
ENST00000516178
80 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU6-1094P-201
ENST00000362416
104 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU6-246P-201
ENST00000384702
107 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
MIR8485-201
ENST00000401372
91 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
MTND4LP1-201
ENST00000446263
157 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU7-88P-201
ENST00000458752
63 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
Y_RNA.694-201
ENST00000516677
117 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU6-1238P-201
ENST00000517215
102 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
hsa-mir-3607.1-201
ENST00000637229
79 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CUL3
Q13618
RNU6-226P-201
ENST00000363778
107 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
SNORD115-22-201
ENST00000364456
82 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
Y_RNA.365-201
ENST00000365537
102 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
Y_RNA.468-201
ENST00000384298
102 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
RNU7-171P-201
ENST00000459581
62 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
MIR8053-201
ENST00000613344
75 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
MIR494-201
ENST00000349529
81 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
HLA-S-202
ENST00000425174
53 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
RNU6-732P-201
ENST00000516033
103 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
U7.5-201
ENST00000517224
61 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
Y_RNA.313-201
ENST00000365095
103 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
AL353691.2-201
ENST00000443795
59 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
RNU7-134P-201
ENST00000458997
64 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
MIR664A-201
ENST00000626086
82 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
hsa-mir-4536-1.1-201
ENST00000636519
88 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
RNU6-294P-201
ENST00000364999
102 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
RNU6-242P-201
ENST00000384359
107 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
MIR4712-201
ENST00000583750
82 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
MIR1245B-201
ENST00000636115
69 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
Y_RNA.74-201
ENST00000362911
99 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
SNORD113.1-201
ENST00000363280
73 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
Y_RNA.236-201
ENST00000364427
111 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
MIR450A2-201
ENST00000385022
100 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL3
Q13618
RNU6-698P-201
ENST00000363523
107 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNU6-668P-201
ENST00000364180
107 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNU6-34P-201
ENST00000364874
107 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNU6-458P-201
ENST00000384179
107 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
SNORD45A-201
ENST00000384512
84 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
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