Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PDE3BQ13370 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE3BQ13370 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE3BQ13370 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PDE3BQ13370 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms