Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLDN8P56748 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
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CLDN8P56748 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CLDN8P56748 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
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CLDN8P56748 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
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CLDN8P56748 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN8P56748 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
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CLDN8P56748 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
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CLDN8P56748 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CLDN8P56748 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CLDN8P56748 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
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