Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGA1P56199 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGA1P56199 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGA1P56199 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGA1P56199 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGA1P56199 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGA1P56199 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGA1P56199 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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ITGA1P56199 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGA1P56199 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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ITGA1P56199 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGA1P56199 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGA1P56199 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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ITGA1P56199 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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ITGA1P56199 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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ITGA1P56199 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGA1P56199 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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ITGA1P56199 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGA1P56199 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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ITGA1P56199 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGA1P56199 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGA1P56199 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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