Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HOXD10P28358 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
HOXD10P28358 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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HOXD10P28358 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
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HOXD10P28358 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HOXD10P28358 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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HOXD10P28358 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HOXD10P28358 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXD10P28358 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXD10P28358 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HOXD10P28358 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
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