Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GMDSO60547 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GMDSO60547 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GMDSO60547 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GMDSO60547 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
GMDSO60547 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GMDSO60547 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GMDSO60547 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GMDSO60547 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GMDSO60547 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
GMDSO60547 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
GMDSO60547 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
GMDSO60547 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
GMDSO60547 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
GMDSO60547 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GMDSO60547 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GMDSO60547 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GMDSO60547 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GMDSO60547 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
GMDSO60547 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
GMDSO60547 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
GMDSO60547 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
GMDSO60547 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
GMDSO60547 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
GMDSO60547 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
GMDSO60547 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
GMDSO60547 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
GMDSO60547 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
GMDSO60547 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GMDSO60547 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GMDSO60547 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
GMDSO60547 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
GMDSO60547 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
GMDSO60547 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GMDSO60547 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GMDSO60547 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
GMDSO60547 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
GMDSO60547 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
GMDSO60547 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
GMDSO60547 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
GMDSO60547 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
GMDSO60547 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
GMDSO60547 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
GMDSO60547 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
GMDSO60547 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
GMDSO60547 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
GMDSO60547 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
GMDSO60547 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
GMDSO60547 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GMDSO60547 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GMDSO60547 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GMDSO60547 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GMDSO60547 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GMDSO60547 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GMDSO60547 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
GMDSO60547 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
GMDSO60547 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
GMDSO60547 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
GMDSO60547 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
GMDSO60547 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
GMDSO60547 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
GMDSO60547 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
GMDSO60547 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
GMDSO60547 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
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