Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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LHX9Q9NQ69 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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LHX9Q9NQ69 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
LHX9Q9NQ69 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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LHX9Q9NQ69 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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