Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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LINC00301Q8NCQ3 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.5□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
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LINC00301Q8NCQ3 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
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LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
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LINC00301Q8NCQ3 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
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LINC00301Q8NCQ3 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
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LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
LINC00301Q8NCQ3 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
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