Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ME3Q16798 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ME3Q16798 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ME3Q16798 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ME3Q16798 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ME3Q16798 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ME3Q16798 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ME3Q16798 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ME3Q16798 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ME3Q16798 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ME3Q16798 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ME3Q16798 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ME3Q16798 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ME3Q16798 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ME3Q16798 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ME3Q16798 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ME3Q16798 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ME3Q16798 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ME3Q16798 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ME3Q16798 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ME3Q16798 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ME3Q16798 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ME3Q16798 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ME3Q16798 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ME3Q16798 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ME3Q16798 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ME3Q16798 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ME3Q16798 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ME3Q16798 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ME3Q16798 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ME3Q16798 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ME3Q16798 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ME3Q16798 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ME3Q16798 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ME3Q16798 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ME3Q16798 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ME3Q16798 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ME3Q16798 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ME3Q16798 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ME3Q16798 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ME3Q16798 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ME3Q16798 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ME3Q16798 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ME3Q16798 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ME3Q16798 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ME3Q16798 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ME3Q16798 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.2 ms