Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PKN1Q16512 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKN1Q16512 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PKN1Q16512 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKN1Q16512 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PKN1Q16512 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PKN1Q16512 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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