Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIK4Q16099 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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GRIK4Q16099 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIK4Q16099 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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GRIK4Q16099 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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GRIK4Q16099 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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GRIK4Q16099 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIK4Q16099 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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