Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NKX1-1Q15270 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NKX1-1Q15270 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NKX1-1Q15270 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NKX1-1Q15270 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NKX1-1Q15270 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NKX1-1Q15270 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NKX1-1Q15270 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NKX1-1Q15270 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NKX1-1Q15270 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NKX1-1Q15270 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NKX1-1Q15270 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NKX1-1Q15270 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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