Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPN13Q12923 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
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