Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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HOXA4Q00056 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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HOXA4Q00056 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
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HOXA4Q00056 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXA4Q00056 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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HOXA4Q00056 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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HOXA4Q00056 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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HOXA4Q00056 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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