Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KIF1CO43896 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KIF1CO43896 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KIF1CO43896 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KIF1CO43896 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
KIF1CO43896 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
KIF1CO43896 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KIF1CO43896 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KIF1CO43896 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291 ms