Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PnckQ9QYK9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms