Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edf1Q9JMG1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms