Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc8Q9CYA6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms