Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs2Q3V3Q7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms