Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnga1P29974 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga1P29974 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms