Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01666 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01666 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01666 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01666 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms