Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx7F8VPJ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx7F8VPJ6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms