Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms