Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL19A1Q14993 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL19A1Q14993 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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COL19A1Q14993 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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COL19A1Q14993 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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COL19A1Q14993 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL19A1Q14993 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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