Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NCOA4Q13772 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCOA4Q13772 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NCOA4Q13772 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
NCOA4Q13772 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NCOA4Q13772 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 360.9 ms