Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ATMQ13315 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ATMQ13315 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ATMQ13315 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ATMQ13315 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ATMQ13315 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ATMQ13315 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ATMQ13315 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-3.35□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ATMQ13315 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-3.36□□□□□ -2.95
ATMQ13315 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ATMQ13315 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ATMQ13315 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ATMQ13315 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ATMQ13315 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ATMQ13315 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ATMQ13315 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
ATMQ13315 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
ATMQ13315 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
ATMQ13315 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ATMQ13315 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ATMQ13315 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ATMQ13315 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ATMQ13315 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ATMQ13315 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
ATMQ13315 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
ATMQ13315 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ATMQ13315 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ATMQ13315 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ATMQ13315 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ATMQ13315 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ATMQ13315 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ATMQ13315 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ATMQ13315 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ATMQ13315 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ATMQ13315 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ATMQ13315 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ATMQ13315 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ATMQ13315 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ATMQ13315 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ATMQ13315 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ATMQ13315 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ATMQ13315 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ATMQ13315 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ATMQ13315 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ATMQ13315 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ATMQ13315 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ATMQ13315 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ATMQ13315 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
ATMQ13315 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
ATMQ13315 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
ATMQ13315 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
ATMQ13315 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
ATMQ13315 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
ATMQ13315 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ATMQ13315 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ATMQ13315 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ATMQ13315 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ATMQ13315 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ATMQ13315 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ATMQ13315 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ATMQ13315 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ATMQ13315 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.49□□□□□ -2.97
ATMQ13315 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ATMQ13315 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ATMQ13315 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ATMQ13315 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ATMQ13315 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
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