Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LRRC38Q5VT99 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LRRC38Q5VT99 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LRRC38Q5VT99 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.3 ms